Genômica e Metagenômica Aplicadas à Biotecnologia

Desenvolvimento de programas, fluxos analíticos e pipelines customizados para mineração de genomas e metagenomas, integrando Bioinformática e Inteligência Artificial para a prospecção in silico de microrganismos benéficos, genes de interesse e alvos com potencial funcional e biotecnológico.

Exemplo de pesquisa relacionada:

Artigo na Science Advances

IA e Bioinformática para Descoberta de Enzimas e Produtos Naturais

Aplicação de Bioinformática e Inteligência Artificial para anotação funcional em larga escala, priorização de enzimas e exploração do potencial biossintético de microrganismos, com foco em descoberta e inovação biotecnológica.

• Anotação funcional de enzimas, incluindo CAZymes, em genomas e metagenomas com foco em aplicações industriais.
• Mineração de genomas e metagenomas para identificação de BGCs e famílias de gene clusters.
• Predição de especificidade de substrato de enzimas com Bioinformática e IA.
• Análises filogenéticas e evolutivas de proteínas.

Exemplo de pesquisa relacionada:

FAALPred

Genômica Comparativa e Filogenômica

Estruturação de análises para acesso, integração e exploração de bases de dados públicas em larga escala, incluindo genomas e proteomas, com comparação genômica por pipelines customizados, análises filogenômicas e geração de relatórios interpretativos.

Diversidade Genética e Análise de Comunidades

Análises de comunidades microbianas e ecológicas a partir de dados de metabarcoding e metagenômica, com foco em perfil taxonômico, diversidade, estrutura comunitária e identificação de padrões biológicos entre grupos.

• Classificação taxonômica e perfil de comunidades.
• Estimativas de diversidade alfa e beta.
• Análises de ordenação e agrupamento, como NMDS, PCoA e abordagens correlatas.
• Análises de abundância diferencial para identificação de padrões ecológicos e diferenças entre grupos.

Mentoria Estratégica e Capacitação

Planejamento estratégico de pesquisas, estruturação de análises bioinformáticas e capacitação de equipes técnicas para apoio a artigos científicos, dissertações e teses.

• Planejamento das análises.
• Estruturação do fluxo de trabalho.
• Definição de estratégias analíticas.
• Treinamento customizado de equipes.