Leandro de Mattos Pereira

Leandro de Mattos Pereira

Leandro de Mattos Pereira Sou pesquisador e biólogo (CRBio-2 143240), com doutorado em Biologia Computacional e de Sistemas pela Fiocruz (RJ), mestrado em Biociências e Biotecnologia pela UENF e graduação em Ciências Biológicas pela UENF, com ênfase em Biotecnologia. Realizei ainda seis pós-doutorados — na PUCRS, HCPA, UFRJ, Fiocruz, ITV e CIIMAR (Portugal) — na área de Bioinformática aplicada à Parasitologia, Microbiologia, Virologia e Biotecnologia. Atuo em bioinformática e análise de dados ômicos (genômica, transcriptômica, proteômica e metagenômica), com experiência em anotação funcional, descoberta de enzimas, reconstrução de vias metabólicas, genômica comparativa e filogenômica, mineração de clusters de genes biossintéticos (BGCs), análises de metabarcoding e análises estatísticas para índices ecológicos de diversidade. Trabalho principalmente com Python e R, aplicando metodologias de ciência de dados e aprendizado de máquina — desde métodos clássicos (Random Forest, SVM e redes neurais profundas) até LLMs (como GPT-J), incluindo fine-tuning e RAG.

Desenvolvo pipelines de ponta a ponta — desde a aquisição e curadoria de dados, passando pelo processamento e modelagem, até a disponibilização de resultados em soluções do tipo Software as a Service (SaaS), incluindo configuração de ambientes, configuração da infraestrutura de rede e implantação em produção. Esses pipelines integram machine learning clássico com modelos baseados em transformers (por exemplo, BERT e ESM2) e abordagens baseadas em embeddings (como word2vec) para prever a especificidade de substrato de enzimas. Tenho interesse em integrar Bioinformática e IA para gerar conhecimento aplicável, com impacto em biotecnologia, preservação ambiental e desenvolvimento sustentável.